El valor por defecto de innodb lock timeout es de 50 segundos.
1.- Accedemos a mysql como usuario root
mysql -uroot -p
2.- Modificamos el valor por defecto del parámetro innodb lock timeout:
set innodb_lock_wait_timeout=100
3.- Reiniciamos mysql :
sudo service mysql restart
4.- Verificamos:
mysql> show variables like 'innodb_lock_wait_timeout';